防控肠道传染病是灾后防疫的关键。由于本次台风过后受灾地区仍持续降雨，疾控部门便采取先入户指导水源消毒和加强水厂水质监控，后消杀外环境的步骤进行。苍南县作为本次台风中受影响最大的县，在及时启动预案，对全县11个肠道门诊进行主动搜索的同时，卫生防疫应急队、卫生监督应急队则对集中式供水单位实行动态监测，分片区对食品生产经营单位进行监督检查，随后马上跟进指导群众进行外环境消杀。
到目前为止，苍南县已出动防疫人员257人次，卫生监督人员130人次，消毒水厂36个，消毒家庭6481户，监督检查570户次，没收不合格食品80公斤。
"圣帕"台风中伤亡最严重的苍南县龙港镇对重点村外环境进行彻底消杀同时，加强了对猪肉、水产品的检验，对各菜市场、酒店进行排查检测，严禁病死畜禽流入市场，确保群众吃的放心。镇有关部门劝告遇难者家属一律不准办酒席。火葬场开通了绿色通道。
