据了解，随着海岛游的火热，南麂客流量每年都呈上升趋势，2013年，南麂客流量突破15万人次，2014年达到18.9万人次，创下历史新高。
但综合考虑南麂岛特殊环境、旅游接待能力、生态保护、船舶安全运行等因素，并根据平阳县人民政府办公室《南麂客运航线安全管理及游客滞留应急工作方案》文件要求，南麂列岛国家海洋自然保护区管理局会同鳌江镇人民政府、平阳县港航管理局、温州鳌江海事处等部门研究决定，从6月下旬开始严格实行南麂游客总量控制，即在旅游高峰期每日进岛游客人数原则限制在1300人以内，其中鳌江至南麂航线每日上限控制在900人以内，瑞安至南麂航线每日上限控制在400以内。
目前，市民可通过电话订票预约(63653991/63651993)或者窗口售票联系鳌江港客运站，而网上购票系统也将在月底投入使用；以及拨打瑞安港客运站(65613916)来提前知晓上岛人数。
